Seguridad: Cómo cifrar y descifrar archivos en Linux

Uno de los campos donde quizá siempre me he considerado un aficionado (por mucho que lea y estudie sobre ello) es en de los algoritmos de cifrado, quizá por que hay tantos y las explicaciones tan enrevesadas, que uno pierde el hilo fácilmente, pero recuerdo de alguna que otra...